1992-ben Shannen vendégszerepelt a The Dennis Miller Show című műsor negyedik adásában. Mivel a show még gyerekcipőben járt, Miller, a műsorvezető, még épp kezdett hozzászokni a talk-show rendszeréhez. A riport elején azonban Shannen gorombán megkérdezte Millertől, hogy ideges-e, és továbbmenve megjegyzést tett szemöldökének ideges rángására. Másnap ez több helyen is címlapsztori volt, Miller, pedig állandóan visszatért műsorában az esetre, hogy ezzel gúnyolja a színésznőt. A Blindfold: Acts of Obsession (1994) forgatásán megismerte Judd Nelsont, akivel később eljegyezték egymást. Úgy hírlik, rövid románca is volt Dean Cain-nel, akit itthon leginkább Superman sorozatból ismerhetünk. 2000-ben felajánlották neki a Sikoly 3 egyik szerepét. 1995-ben egyik főszereplője volt a Kevin Smith rendezte Shop-show-ban, amelyben egy képregényfüggő sráccal bonyolódott viharos kapcsolatba. Kisebb szerepet kapott az ugyancsak Kevin Smith rendezte Jay és Néma Bob visszavág című komédiájában 2001-ben, ahol saját magát alakította egy "Sikoly" film forgatásán a Miramax stúdióban. Szintén ebben az évben készült a Ha eljön a tegnap (Another Day) című misztikus filmje. 2006-ban önálló TV-műsort kapott, melynek címe: 'Breaking Up With Shannen Doherty'. A műsor alatt Shannen segít szakítani a pároknak, vagyis hogy veszekedés nélkül váljanak el, barátokként.A Parker Lewis sohasem veszít-ben is szerepelt. Mások sikerszerepe a Bűbájos boszorkák-ban alakított egyik címszereplő. Shannenről a Bűbájos boszorkákból való kilépése után nem igen lehetett hallani, bár próbálkozott azóta néhány új filmmel, de egyikkel se ért el ezidáig túl nagy sikereket. Egy 2008-as újdonságban, a 90210 1. részében fog feltűnni, mint a Beverly Hills 90210 Brenda Walsh-ja.